Le Mont Fuji et la lance ensanglantée

Un jeune samouraï, Shojuro Sako, voyage sur la route d'Edo en compagnie de ses deux serviteurs, Genta et Gonpachi. Mais la route et dangereuse et les trois hommes vont devoir faire preuve de bravoure pour arriver à leur destination.

Tokyo, fin du XIXe siècle. Cinq ans ont passé depuis les premières aventures de Sanshiro Sugata. Le vaillant judoka perfectionne son art du judo au près de Yano, son maître vénéré. Il est toujours autant épris de Sayo, la fille de l'un de ses anciens adversaires. Mais c'est un autre vieil ennemi qui lui cause plus de soucis. Les deux frères de Gennosuke Hikagi ne rêvent que de vengeance et menacent dangereusement Sanshiro. Ce dernier devra d'abord vaincre un boxeur venu d'Amérique avant de relever l'ultime défi lancé par les deux frères : un combat pieds nus au sommet d'une montagne enneigée.

Au Moyen-Age, la tranquillité d'un petit village japonais est troublée par les attaques répétées d'une bande de pillards. Sept samouraïs sans maître acceptent de défendre les paysans impuissants.

En 1882, Sanshiro Sugata débarque dans un port japonais pour apprendre le jiu-jitsu auprès du maître Momma. Mais c'est finalement le judo, par l'intermédiaire d'un autre grand maître, qu'il choisira. Entre les deux écoles, l'affrontement sera sévère.

Zatoichi se retrouve bien malgré lui à assister à une cérémonie d'un clan yakuza dont le chef, aveugle lui aussi, est surnommé "le shogun de l'ombre". Le "parrain Zatoichi" est d'abord accueilli avec bienveillance, puis méfiance lorsque le groupe s'aperçoit de ses opinions très personnelles. Le "shogun de l'ombre" décide d'envoyer une tueuse contre Zatoichi, pour le séduire et ensuite l'assassiner. Mais celui-ci va en tomber amoureux...